Câu chuyện bắt đầu bằng cuộc trò chuyện của những người ngoài hành tinh vê việc tiêu diệt loài người bởi vì họ đang tàn phá rừng trên Trái đất. Nôbita tình cờ phát hiện một cái cây con và giúp nó có thể tự di chuyển được nhờ Thuốc chuyển hóa thực vật thành động vật của Đôrêmon. Cậu đặt tên cho nó Ki-bô. Ki-bô rất thông minh, ham học hỏi và được mọi người yêu quý.Một lần Nôbita và nhóm bạn dạo chơi trong rừng, họ phát hiện một vùng rừng đang bị phá bỏ để xây dựng công trình. Sau đó họ bị hút vào thế giới của hành tinh Thực vật.